課程資訊
課程名稱
 Python 在生物學的應用
Python for Biologist 
開課學期
 109-2 
授課對象
 生命科學院  生態學與演化生物學研究所  
授課教師
 巫孟叡 
課號
 EEB5094 
課程識別碼
 B44EU2060 
班次
  
學分
 2.0 
全/半年
 半年 
必/選修
 選修 
上課時間
 星期五5,6(12:20~14:10) 
上課地點
 生科419 
備註
 本課程以英語授課。修課學生須自備筆記型電腦。與王弘毅合授
限生命科學院學生(含輔系、雙修生)
總人數上限：20人 
Ceiba 課程網頁
 http://ceiba.ntu.edu.tw/1092EEB5094_ 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
 核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

Python在科學的各個領域裡都被廣泛的運用，其處理字串的強大能力更使得Python在生物的各領域如基因組、轉錄組、蛋白組等也被大量的使用。此外Python語法簡潔直觀，又因為大量被使用所以有許多支援的工具，因此很適合程式語法者學習。
本課程將從基本的程式環境與語法開始，漸次指導學生如何利用串列、迴圈、條件運算式處理大量的資料。 

課程目標
 讓學生能夠學得如何用程式解決生物學方面的問題 
課程要求
 對程式語言有興趣的生科院學生 
預期每週課後學習時數
  
Office Hours
  
指定閱讀
 待補 
參考書目
 Python for Biologist by Dr. Martin Jones 
評量方式
(僅供參考)
  
No.
項目
百分比
說明
1. 
 Final Project 
30% 
  
2. 
 Homework 
70% 
  
 
課程進度
週次
日期
單元主題
Week 1
 2021/02/26  Installation and the first taste of Python 
Week 2
 2021/03/05  The command line 
Week 3
 2021/03/12  The basic data types I 
Week 4
 2021/03/19  The basic data types II 
Week 5
 2021/03/26  Functions 
Week 6
 2021/04/02  Break (No lecture) 
Week 7
 2021/04/09  Conditionals 
Week 8
 2021/04/16  List, tuple and loops I 
Week 9
 2021/04/23  List, tuple and loops II 
Week 10
 2021/04/30  (continue from last week) 
Week 11
 2021/05/07  Dictionaries I (including reading files) 
Week 12
 2021/05/14  Dictionaries II (including writing files)  
Week 13
 2021/05/21  Nested data structure, module, and exception 
Week 14
 2021/05/28  Parsing with state machine 
Week 15
 2021/06/04  BioPython 
Week 16
 2021/06/11  Numpy and Pandas 
Week 17
 2021/06/18  Plotting with Matplotlib and Seaborn 
Week 18
 2021/06/25  Final project presentation